Calasanz no dejó nunca de querer esta su tierra natal de Peralta de la Sal. Y aunque a sus 32 años emprendería un viaje definitivo a Roma, y nunca volvería a esta su casa, sin embargo su corazón y su boca rebosan de cariño y agradecimiento para con este su pueblo.
La villa de Peralta de la sal, capital de la Baronía Castro-Peralta, era en 1557 una población llena de vida y de orgullo, con unos setenta hogares llenos de niños y niñas. Entre sus pobladores, la familia de Pedro Calasanz y María Gastón, al frente de la herreria y de la representación de la villa como Baile de Peralta y leal vasallo de los señores de Castro.
Fue en los funerales de nuestro santo donde un vecino de Roma, José Marquez, natural del mismo pueblo del que ya era nombrado por toda Roma como el santo viejo, comenzó a contar anécdotas y sucesos de los años de su infancia, subrayando destacadas cualidades de aquel niño, que ya apuntaba maneras.
Versado en las cosas de Dios, seguramente catequizado por una madre creyente y amiga de Jesús y de María, podía recitar los Milagros de Nuestra Señora de Berceo sin equivocarse, para asombro de amigos y educadores.
Leído en profundidad tenemos un proceso educativo profundo, que verá su fruto después. Allá en Peralta, además de los martillos de la fragua se percibe otro rumor, mucho más suave, el de la madre, que reúne a sus hijos e hijas para educarlos en la piedad cristiana.
Juan Calasanz, el primogénito, muere muy pronto. El hereu, Pedro, que también morirá pronto en las revueltas de la Ribagorza. Y después muchas chicas, llega José, el último de ocho.
José recibe de su familia una gran carga de valores y creencias: el honor (la moneda de cambio de las sociedades preindustriales: si pierdes el honor no eres nada); el temor de Dios, y la obediencia a los poderes establecidos, honrarás padre y madre y respetar las jerarquías vigentes. La mujer, la madre de Calasanz, se convierte en transmisora de valores y se erige en la encarnación más perfecta de esos valores. Lo aprendido por Calasanz estos primeros años deja una huella imborrable. Se puede hacer una lectura de los textos calasancios a partir de esta tríada de valores. Dejará huella en el futuro, por ejemplo, la impronta mariana, que acompaña todo el itinerario calasancio (el nombre de María quedará en nuestro escudo, y querrá a las escuelas siempre a su amparo y protección).
Si recorremos el tratado Mariano que Calasanz nos deja, la Corona de las Doce Estrellas, siendo una devoción, es todo un itinerario de la vida de María, recorriendo sus invocaciones vemos todo el itinerario de la vida de María Es un “estelario”, que copia de otros (en concreto de Juan de Jesús María, Carmelita). Cambia un verso: contempla a María como maestra y educadora de Jesús: esta invocación es original, no estaba en otros estelarios. Está proyectando en María lo que su madre hizo con él y sus hermanos.
De aquel hombre paisano de José nos llega también la anécdota del puñalito y el deseo de acabar con el enemigo de Jesús, premonición de su lucha contra los males en que se concretaba en aquellos siglos. José Marquez contó otra cosa. “No os maravilléis de que este siervo de Dios sea santo, porque ya de niño siendo yo su paisano y de su misma edad, poco más o menos, se salió de casa con un puñalito en la mano. Preguntándole yo, me dijo “quiero ir a matar al demonio, porque es enemigo de Dios”. Tendría entonces 5 años, más o menos”

Abandonó Valencia con premura, quizá por no hacer crecer una posible relación sentimental. Residía en casa acomodada, prestando servicios de secretariado; y de ella salió evitando instigaciones y cumpliendo el consejo de su director espiritual. Finalizará sus estudios teológicos en Alcalá. Tanto en Valencia como en Alcalá, le atraen las nuevas corrientes teológicas de los jesuitas. Parece que se dirige espiritualmente con algún Jesuita, que es quien le dice que los jesuitas han abierto unas clases de teología abiertas también a no seminaristas, en Valencia. Hay varios centros, pero él estudiará con los jesuitas en San Pablo, como externo. Destacamos que aquí tampoco tuvo formación seminarística.
Hay un segundo período universitario leridano en José de Calasanz (1580-1583); ahí terminó los estudios teológicos y la Sagrada Escritura, iniciados en Valencia (1577-1578), continuados en Alcalá de Henares (1578-1579); se graduó con el título de bachiller y obtuvo la consideración académica de profesor de teología.
No es común, en el siglo XVI que un muchacho de pueblo salga pronto, vaya de una universidad a otra… En el tiempo de estudios de Calasanz tenemos al menos certificados 3 o 4 lugares de estudios (luego se sacaría el doctorado en teología en Barcelona; sabemos que es doctor en Barcelona por los certificados estudiados por Santha). Tenemos un ejemplo de todo lo contrario: un hombre que sale de su casa. Tiene una formación universitaria muy superior a la media, que le costó sus dineros y le puso en contacto con experiencias significativas.
Este recorrido no es casual. Tiene un poco de desorden, pero hay un criterio que lo explica. Va redirigiendo su proyecto vital buscando lo mejor, lo más adecuado a sus inquietudes, y en obediencia y escucha de lo que va descubriendo en su propio corazón. La búsqueda de lo mejor, la excelencia. Es algo que veremos continuamente en su itinerario. Apuesta siempre a la excelencia.
Estudia, pero no sólo estudia: acompaña y exhorta a sus compañeros, lo vemos tomando decisiones, lo vemos ante la tesitura del enamoramiento… teniendo que decidir ante la situación familiar tras la muerte de madre y hermano, defendiendo el sacerdocio. Son experiencias que le amueblan el corazón para vivir la vida como sacerdote. Mateo González le llamaba: su Espíritu Santo, el que me cuida y me guarda, el que me saca de los apuros.
Este periodo deja en Calasanz una estructura humana e intelectual que le va a acompañar siempre: ha estudiado mucho y ha estudiado bien. También deja en él una actitud ante el estudio y el trabajo intelectual. Porque se toma así su tiempo de estudio puede preguntarse por su forma de vida. El tiempo de estudio es un tiempo de preguntas y cuestionamientos y se los plantea en serio hasta el punto de enfrentarse a la familia. Dará una importancia grande a la formación de los educadores. De su tiempo también le quedó la insistencia en querer para los suyos a los formadores más preparados. Como a Santa Teresa, Calasanz se conserva también amigo de buenos libros.

Vuelve Calasanz a Peralta de la Sal, y se establece por un año en el hogar de una de las hermanas, donde también ha sido acogido su padre Pedro. Había quedado José sin valedor ni cargo determinado, y se centró en ayudar al rector de la parroquia de la población. Es en estos meses donde Pedro enfermó y fue José consuelo material y espiritual, alentándole y animándole a recibir con gratitud la voluntad de Dios. Quedaría Peralta grabada a fuego pues en el corazón de José como el lugar de las despedidas y la aceptación, en unos meses tranquilos y devotos. Corría el año 1586.
Y ya en febrero de 1587 situamos a Calasanz en la Seo de Urgell como maestro de ceremonias y secretario del cabildo de canónigos. El obispo de la Seo de Urgel, Hugo Ambrosio de Moncada, el mismo que le había ordenado en Sanauja, habría intervenido en estos nombramientos. Pero estando José en Peralta éste había fallecido. Fue en este momento de sede vacante cuando el cabildo vio necesaria una visita apostólica por los arciprestazgos. José será nombrado secretario del archidiácono visitador Rafael Gomis. Durante cuarenta días visitaron Tremp, Balaguer, Guissona, Agramunt, Sanahuja, Oliana y Pons. El resto del tiempo de aquél año lo pasó Calasanz en casa de un comerciante en Seo de Urgel.
En Seo de Urgel redactó actas capitulares y administró los haberes de la corporación catedralicia; dio pruebas de su caridad para con los necesitados y se relacionó con las comunidades religiosas de la ciudad, tanto dominicos como agustinos. En enero de 1589 empezó a desempeñar la mayordomía del palacio episcopal, interviniendo en las colaciones o asignaciones de beneficios eclesiásticos de la diócesis.
Siendo Calasanz maestro de ceremonias y secretario del Cabildo de Urgel, fue nombrado plébano de las parroquias conjuntas de Claverol y Ortoneda. Era una prebenda no residencial, pero con la obligación de proveer con un vicario residente. Renunció a la doble plebanía el 6-9-1591, ya con miras de su viaje a Roma, pero dejó un Monte de Piedad o depósito de trigo para ayuda a los pobres del lugar. Al pie de la colina se halla el caserío de «Pont de Claverol», donde vivía la familia Montes, en cuya casa solía hospedarse José y con quien mantuvo estrecha amistad.
Vivió en Seo de Urgel hasta junio de 1589 en que su obispo, don fray Andrés Capilla, le nombró oficial eclesiástico (arcipreste) de Tremp, villa, como Seo de Urgel, del señorío temporal del obispo urgeliano.
En la villa de Tremp (junio de 1589 a septiembre de 1591) José Calasanz desempeñó el cargo de oficial eclesiástico (arcipreste), con autoridad judicial o civil en los lugares del señorío episcopal. Durante el mismo período fue rector de las parroquias rurales de Claverol y Ortoneda, y se le encomendó la reforma de los tres arciprestazgos pirenaicos de Sort, Tirvia y Cardos (parroquias, hospitales, bienes eclesiásticos, fundaciones pías, etc.).